同一窝柯基可以配对吗

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不可以。

同一窝的狗狗交配，属于近亲繁殖，后代易出现近亲病，生命力低。

同一窝狗狗的基因来自于同一对父母，如近亲繁殖，后代基因纯合的机率大增。隐性致病基因如处于和显性基因杂合时，隐性基因的作用被显性基因遮盖，并不能发病。如隐性致病基因纯合，则表现为隐性性状，即发病。所以，近亲繁殖，隐性基因易纯合，发病率高。

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